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要發表一篇高質量的SCI臨床研究論文，研究設計是非常關鍵的。很多醫生的論文之所以被拒稿，就是因為在研究設計方面存在較為嚴重的缺陷。比如說，該有對照的文章缺乏對照、需要大樣本的時候樣本量很小、有一些較為嚴重的影響因素沒有考慮清楚等。
對這類有設計缺陷的文章，即使寫作功底再強，要想將文章發表到SCI期刊上，也會心有余而力不足。像這類文章，要么從設計開始重新進行研究，要么就是調整研究方向，在現有基礎上進行數據補充，而后才有機會發表。但無論是重新研究還是補充數據，都需要投入更多的時間和人力。
一般來說，一篇合格的SCI臨床研究論文，應當包括以下的要點：
1.合理的對照組：一般是以國際上廣泛認同的同類事物作為對照。
2.合理的樣本選擇(納入排除標準)：針對臨床研究對象的長處進行樣本選擇，并制定納入排除標準。
3.樣本量：針對比較常見的病例，樣本量基本上都要達到100例以上，而對稀有的罕見病例，可以酌情用小樣本。
4.分組方法：一般采用的是隨機分配和自愿入組。
5.研究指標：要針對臨床研究對象的長處選擇，可以突出優勢。
6.研究的時間跨度：針對臨床研究對象的情況進行設定，可對短期、中期、長期臨床進行研究，一般中長期的研究結果更受歡迎。
7.結果展示：首先要分析組間有無基線差異，一般都是在保證基線無差異的情況下進行臨床比較，然后開始比較結果和安全性。
8.論文價值：即研究對象的臨床價值，任何設計都應該是圍繞這一點進行的。
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